La méta-analyse de modificateurs génétiques révèle des voies dérégulées candidates dans la sclérose latérale amyotrophique

Résumé : La sclérose latérale amyotrophique (SLA) est une maladie neurodégénérative qui présente un chevauchement important avec la démence frontotemporale (DFT). Cependant, la variabilité clinique observée chez les patients atteints de SLA suggère que des gènes supplémentaires ont un impact sur la pathologie, la susceptibilité, la gravité et / ou la progression de la maladie. Pour identifier les voies moléculaires impliquées dans la SLA, nous avons entrepris une méta-analyse de modificateurs génétiques publiés, à la fois chez des patients et dans des organismes modèles, et nous avons effectué une analyse des voies bioinformatiques. À partir de 72 études publiées, nous avons généré une liste de 946 gènes dont la perturbation (1) affectait la SLA chez des populations de patients, (2) des défauts altérés dans des modèles de laboratoire ou (3) des défauts modifiés causés par une perte de fonction du gène de l'ALS, gène. Ici, ils sont tous appelés gènes modificateurs. Nous avons trouvé 727 gènes modificateurs qui codent pour des protéines avec des orthologues humains. Parmi ceux-ci, 43 gènes modificateurs ont été identifiés comme modificateurs de plus d'un gène / modèle de SLA, ce qui correspond à l'hypothèse selon laquelle des gènes et des voies partagés peuvent être à la base de la SLA. De plus, nous avons utilisé une analyse bioinformatique basée sur une ontologie génétique pour identifier des voies et des gènes associés pouvant être importants pour la SLA. À notre connaissance, il s'agit de la première étude complète sur les gènes modificateurs de la SLA. Ces travaux suggèrent que des mécanismes moléculaires communs peuvent être à la base de la pathologie causée par différents gènes de la maladie de la SLA. Étonnamment, peu de gènes modificateurs de la SLA ont été testés dans plus d’un modèle de maladie. Comprendre les gènes qui modifient les défauts associés à la SLA aidera à élucider les voies moléculaires à la base de la SLA et fournira des cibles supplémentaires pour une intervention thérapeutique. Faits saillants, es modificateurs génétiques contribuent à la variabilité phénotypique de la SLA. Création d'une liste complète de modificateurs génétiques connus de la SLA. L’analyse bioinformatique et les résultats des modificateurs génétiques partagés relient les gènes causant la SLA. Les mécanismes pathologiques sous-jacents de la SLA peuvent être révélés à l'aide de cette approche.

Traduction : Christina Lambrecht

Source : National Digital Science Library